Основная работа профсоюзного комитета организована через соответствующие комиссии. Комиссии сформированы из членов профкома и профсоюзного актива. Соответственно направлениям работы, комиссии в рамках установленного регламента самостоятельно работают с членами профорганизаций, службами университета, выходят на вышестоящие профсоюзные органы, готовят вопросы для рассмотрения на заседаниях президиума, профкома, профсоюзной конференции, конференции трудового коллектива университета. Состав и планы работы комиссий утверждаются на заседаниях профкома. Соответственно планам работы профкома комиссии ежегодно представляют отчеты о своей работе и готовят соответствующие разделы к общему отчету профсоюзного комитета.
